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近期预告

2023.04.25-28 生物医学公共数据深度挖掘及应用培训班


还在认为没有实验就不能发表论文?

手头有很多数据,不知道该怎么进一步挖掘?

还在为不知道如何找靶点而苦恼?

还在为不精通挖掘GEO、TCGA等数据库而痛苦不堪?

还在为不会那些高大上的图表而暗自伤神?

快来参加北京市计算中心举办的生物医学公共数据深度挖掘及应用培训班吧!

本次培训对目前公共数据挖掘热点进行系统介绍,提供一次系统了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等数据库数据产生、分析及挖掘的课程。通过大量演练操作,帮助科研人员利用这些公共数据库挖掘多组学数据,以便为自身科研项目服务。欢迎报名参加。更多消息可关注“生信会议”公众号,会给您带来更多惊喜!

授课对象:

从事生物医学研究的临床医生、转化研究科研人员;

课题经费不足,无法进行大规模测序,但需要发表SCI论文的相关研究人员;

已获得转录组、基因组等多组学数据,需要进一步挖掘分析人员;

对生物医学大数据分析与挖掘感兴趣的其他人员。

培训效果:

短、平、快,为基金申请保驾护航,发表paper如虎添翼;

掌握多组学数据分析核心技能,GEO、TCGA、SRA数据处理没有压力;

科研绘图:以一敌百,高端大气,私人订制;

一套数据多角度演练,更易掌握分析思路。

主办单位:北京市计算中心有限公司

协办单位:北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2023年4月25-28日  9:30-11:30 下13:30-17:00

时间

主题

内容

备注

第一天

组学及生物信息学概述

1、组学研究概述(基因组学、转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学及相关技术介绍)

2、实验设计及测序原理

3、生物信息学背景知识介绍

理论

公共数据库挖掘热点介绍

1、人工智能研究在病理切片识别上的应用

2、人工智能多组学数据整合分析

理论

常用生物医学数据库介绍

1、用生物医学数据库介绍:

1)大型综合数据库:NCBI、UCSC

2)公共高通量测序数据库:SRA

3)公共基因表达谱数据库:GEO

4)公共癌症多组学数据库:TCGA

2、各大数据库数据下载

理论

+演示

第二天

R语言入门

1、R语言简介

2、R语言安装及配置

3、R语言数据结构

4、R语言数据处理

5、R语言绘图

理论

+实战

基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练(一)

1、差异表达分析及结果可视化:

1)edgeR包使用

2)火山图绘制

3)聚类热图绘制

2GO、KEGG功能富集分析及结果可视化:

1)GO富集分析

2)KEGG富集分析

3)富集分析气泡图绘制

理论

+实战

第三天

基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练(

生存分析及结果可视化:

1)生存分析、cox模型基本原理介绍

2)模型评估基本原理介绍

3)R语言进行生存分析、生存曲线绘制

4R语言单变量、多变量cox模型构建

5R语言条件逻辑回归模型构建

6R语言ROC曲线评估模型

7HR、OR值计算,模型解释

理论

+实战

基于公共数据的Biomarker挖掘鉴定演练(

生物分子网络分析及可视化:

1网络简介

2网络分析(拓扑结构分析、关键基因识别)

3生物分子网络介绍

4利用string数据库查询基因/蛋白相互作用

a.单个基因/蛋白生成相互作用网络

b.多个基因/蛋白相互作用网络分析

c.调研靶标信息少时如何拓展

5利用cytoscape工具构建相互作用网络并分析

理论

+实战

第四天

多组学数据联合分析演练(一)

1、表观组高通量数据原理

2、甲基化与转录组整合分析思路

3、表观组公共数据库:ENCODE、regulomeDB

理论

1、甲基化数据预处理

2差异甲基化位点及区域识别

3差异分析结果可视化

实战

多组学数据联合分析演练(二)

lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练

1)lncRNA表达谱数据获取

2)miRNA靶基因分析

3)lncRNA与mRNA表达相关性分析

4)ceRNA网络构建及结果可视化

理论

+实战

注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。


报名费用

注册费:4800元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。

提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。


名优惠政策

13人以上团体报名每人可减少300元;

24+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。


付费方式

手机银行或电子银行转账、银行汇款等

单位全称:北京市计算中心有限公司

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京自贸试验区永丰基地支行

(汇款信息备注:智能计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。


报名回执

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咨询请联系

QQ号:2814500767

邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn

徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)

员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)

开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。


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