实用生物信息学研讨班
如您所知,近年来,以基因组科学为代表的研究工作和技术平台先后获得各项资助,如国家863计划、973计划、中国科学院知识创新工程、国家重大攻关项目、自然科学基金等。为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市计算中心特此举办“实用生物信息学”培训研习班。
主办单位:北京市计算中心
协办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地
北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地
举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排:2021年5月17-21日 上午9:30-12:00 下午13:30-17:00
日期
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主题
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内容
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第一天
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生物信息学导论
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1、生物信息学发展简史(重点讲解)
2、生物信息学主要研究领域(重点讲解)
3、生物信息学软件和工具概述
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生物信息学基础
(上机操作)
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1、linux基础
掌握Linux系统下的常用命令(重点讲解)
掌握linux环境下软件的安装使用
了解shell脚本的编写
2、R基础
R语言概述
R包及使用规范
R基础数据结构
R进阶数据结构
R绘图
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第二天
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二代测序技术原理
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1、介绍目前主流二代测序仪的测序原理
2、主要操作流程及特点
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基因组重测序与数据分析
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1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用
2、结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识
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基因组重测序数据分析实例(上机操作)
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1、对二代测序数据的解读
2、数据质量控制及数据过滤
3、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化(重点讲解)
4、寻找SNP和Indel并进行注释(重点讲解)
5、寻找结构变异并对变异进行注释(重点讲解)
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第三天
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转录组测序与数据分析
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1、转录组基本概况和技术发展简介
2、转录组技术流程及技术细节(重点讲解)
3、转录组应用案例
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转录组数据分析实例(上机操作)
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1、转录组数据准备和软件介绍及安装
2、转录组数据的比对(重点讲解)
3、表达量估计和分析(重点讲解)
4、后续功能分析简介
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第四天
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microRNA测序与数据分析
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1、microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义
2、microRNA的生物学过程(重点讲解)
3、microRNA的测序(重点讲解)
4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解)
5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景
6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)
7、近期文献
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microRNA数据分析实例(上机操作)
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1、microRNA测序数据预处理(重点讲解)
2、测序数据长度分布计算
3、microRNA的预测(重点讲解)
4、microRNA碱基偏好性计算
5、microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)
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第五天
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10×单细胞转录组测序数据常规分析流程介绍及上机操作
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1、10×单细胞测序技术在科研领域的应用
2、10×单细胞实验建库原理介绍
3、10×单细胞转录组下机数据处理
4、10×单细胞软件Cellranger讲解及实操(重点讲解)
5、从单细胞表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操
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蛋白结构与互作分析
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PyMol,Cytoscape
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注:课程以实际发生为准;若调,会提前通知。
【报名费用】
注册费:5400元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。培训期间,免费提供工作午餐。
提供当期视频回放以供复习使用(北京市计算中心羽林学院平台)。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【付费方式】
现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)
注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。
【报名回执】
点此填写报名回执
【咨询请联系】
QQ号:2814500767
邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)
员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)
【注】开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。 |