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【线上课程】数据分析与R语言制图实操班(6.16-19)
【线上课程】多组学数据分析及挖掘培训班(6.10-12)
【线上课程】生命科学的数据可视化与科研作图—实用工具与技巧实操班(6.3-5)
【线上课程】基因组关联分析技术应用培训班(5.27-29)
【线上课程】生物信息学Python语言实操班(5.26-29)
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【线上课程】微生物组学数据分析与挖掘专题培训班(5.13-15)
【线上课程】计算机辅助设计—分子模拟与蛋白互作研讨班(5.20-22)
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2020.4.22-25 转录组学专题研讨班
2020.4.15-18 多组学数据分析及挖掘培训班
2020.4.8-10 生命科学的数据可视化与科研作图----实用工具与技巧
2020.3.26-28 生物分子互作常用软件使用培训班
2020.3.19-21 10X Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班

 生物信息学Python语言实操班

Python是一种简单易学,功能强大的编程语言。它有高效率的高层数据结构,能够简单、有效地实现面向对象编程。Python语法简洁,支持动态输入,是解释性语言。在大多数平台上,对于众多领域,Python都是一个理想的开发语言,特别适合于应用程序的快速开发。Python在生物信息领域更是有着广泛的用途,几乎是入门生物信息学的首选编程语言。

课上针对目前实用的众多python扩展包,例如科学计算、网络爬虫等都会有所涉及。

培训特色

1、全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿

2、理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会

3、增值服务,课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答

培训目标

掌握生物信息学与Python的基础知识,学会Python执行最常见的编程,了解BioPython的基本应用,通过生物信息学Python程序实例与应用,深刻理解并掌握生物信息学Python语言使用的要点。

主办单位:北京市计算中心

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地

北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地

授课形式:线上直播

课程安排:2020.5.26-29 上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

日期

授课题目

授课内容

备注

第一天

Python概述及其在生物信息领域的应用

概括介绍Python语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用

操作

Python软件安装、运行与基本操作

Python及iPython的安装及使用,Python程序的运行;DOS、Unix命令行操作基本命令;Python变量定义、数字及基本运算

核心数据类型(1)

列表、元组

操作

基本语法结构

判断结构、循环结构、异常处理

实例练习

使用python编程,生成斐波那契数字序列

第二天

核心数据类型(2)

字符串、字典

操作

文件与文件夹操作

文件的读入与写入、文件夹操作

实例练习

FASTA文件的处理:

1、序列基本信息的统计(序列数、碱基数、及平均长度)

2、fasta序列反向互补转换和切割

第三天

函数和模块

系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用

操作

正则表达式

Python特色功能正则表达式学习与应用

实例练习

系统命令在python中的调用

实例练习

大数据文件的分割及合并

第四天

BioPython简介及应用实例

BioPython安装及学习,生物信息学中的实际应用

操作

BioPython快速应用

使用BioPython处理传统的生物信息数据

实例练习

应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式

应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。

注:课程以实际发生为准。

报名费用

注册费:3600元/人(含本次听课费、上机账号1个、资料费、证书费、考试费(如有),赠送一年内同等金额同课程体系线下班一个和线下7折班一个)。

备注:若您不方便参加线下班可将赠送的线下班换成2个线上班。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

课程结束后,可将上课期间用到的数据、PPT资料、脚本、视频等相关文档,通过移动硬盘邮寄的方式快递到您手上,便于您后续继续学习使用。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

包年优惠价

按年付费,45000元/人。包括报名后1年以内所有线上+线下课程,全年免费参加;高性能计算资源基础账号1个,使用期限1年。

付费方式

银行账号信息:

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

汇款信息备注“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注“生物+您姓名+单位名称”)

报名回执

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咨询请联系

QQ号:2814500767

邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn

徐老师010-59341786,15801436028(微信同号)

员老师010-59341773,18701529461(微信同号)

开课前三天会发送邮件通知;确认开课后,开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。如未收到,请及时电话咨询。

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