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2018.11.1-4月班实用微生物组学信息分析精品班
2018.11.5-7 转录组学专题研讨班
2018.11.8-9组学技术在生命科学中的应用专题培训
2018.11.12-15数据分析与R语言制图专题研讨班
2018.11.16-18生物分子互作的微观过程展示及应用培训班
2018.11.19-23实用生物信息学研讨班
2018.11.28-30微生物组学分析研讨班
2018.10.26-28生物信息学技术应用讲习班
2018年11月3-4日TCGA、GEO及SRA公共数据库深度挖掘与应用培训班
人工智能在基因组数据解读中的应用 高级研修班
2018年统计基因组学培训会
2018.10.8-10实用生物信息绘图研习班
2018.10.11-14生物信息学Python语言培训
2018.10.15-18基于NGS的肿瘤精准医学研究基础培训班
2018.10.19-21生物分子互作常用软件使用培训班
2018.10.22-25生物信息学软件与工具使用培训班
2018.10.29-31基因组变异分析、解读与应用培训班
2018.9.1-2宏基因组分析专题研讨班
2018.9.7-9第三代测序技术及信息分析研讨班
2018.9.14-16分子模拟与蛋白互作研习班

TCGA、GEO及SRA公共数据库深度挖掘与应用培训班 
 

当今,生物医学大数据的产出已经非常庞大,利用这些公共数据资源并融入自己的构想,然后分析解决生物学问题将是以后的关键,也是目前科研的热点。各种公共数据库呈井喷式发展,如TCGA、GEO和SRA。TCGA(癌症基因组图谱)是全球最大的癌症基因信息数据库,是一个多组学的数据库,包括常见癌症的基因组、转录组、蛋白组、表观遗传组数据和与其关联的临床数据,为挖掘有意义的组学变化和发现肿瘤发生、发展、转移等生物学机制提供了海量数据。GEO数据库是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。不仅可以上传自己的数据,而且还可以免费下载数据库中和自己研究方向类似甚至相同的数据来进行分析,为自己的研究提供一些启示或者验证。SRA是NCBI上常用的一个数据库。它接受通过二代测序技术产生的遗传学数据以及与其相关的质控报告。但是面对这些极其有价值的公共数据时,科研人员往往心有余而力不足,而且面对市面上的浩如烟海的各类教程也是一头雾水。本次培训提供了一次系统了解TCGA等数据产生,分析及挖掘的课程,帮助科研人员利用这些公共数据库挖掘多组学数据,以便为自身科研项目服务。
授课对象:从事肿瘤研究的临床医生、转化研究科研人员、在校研究生以及广大临床肿瘤研究领域的爱好者。
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
深圳微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
举办地点:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼,北京市计算中心会议室
举办时间: 2018.11.3-4(报名中)上午930-12:00下午13:30-17:00.


日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

上午

SRA数据库介绍及使用

1、数据挖掘概述;
2、高通量组学研究基础知识;
3、SRA数据库在线工具的应用;
4、SRA数据上传与下载

下午

GEO数据库介绍及使用

1、GEO在线工具的应用;
2、GEO数据下载和数据质量分析;
3、GEO芯片数据处理

第二天

上午

TCGA数据库介绍及使用

1、TCGA数据库基本概念介绍及数据获取
2、操作实战: TCGA数据获取,不同类型数据的使用
3、基于TCGA和GEO数据挖掘文章的深度解析及复现(结合具体实例);

下午

TCGA及生物网络调控分析

1、基因表达谱的PPI网络挖掘
2、利用cytoscape进行miRNA-mRNA互作网络、蛋白质-蛋白质互作网络上机操作

 (课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】  单独参加此班费用为500元,不支持现场刷卡,可提前汇款或现金。 参加20181029-112日培训班,即可获得免费参加此培训班门票。培训座位按收到报名表先后顺序安排。 
【联系咨询】    QQ:2814500767
员老师 010-59341773/1771,18701529461(微信同号)邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn 

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