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人工智能在基因组数据解读中的应用 高级研修班
2018年统计基因组学培训会
2018.10.8-10实用生物信息绘图研习班
2018.10.11-14生物信息学Python语言培训
2018.10.15-18基于NGS的肿瘤精准医学研究基础培训班
2018.10.19-21生物分子互作常用软件使用培训班
2018.10.22-25生物信息学软件与工具使用培训班
2018.10.29-31基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班
2018.9.1-2宏基因组分析专题研讨班
2018.9.3-6数据分析与R语言制图专题研讨班
2018.9.7-9第三代测序技术及信息分析研讨班
2018.9.14-16分子模拟与蛋白互作研习班
2018.9.17-21 基于多组学的慢性疾病研究研讨班
2018.7.30-8.1生物信息数据处理与perl语言编程应用专题培训班
2018.9.7-9生物分子互作机理及计算机辅助药物设计培训班--暑假班
2018.8.13-15生物信息学技术应用讲习班
2018.8.16-17组学技术在生命科学中的应用专题培训
2018.8.20-22基因组关联分析技术应用培训班
2018.8.23-25微生物组学分析研讨班
2018.8.27-31实用生物信息学研讨班

2018年统计基因组学培训会
2018 Statistical Genomics Workshop

参加培训班的学员可以现场与讲课老师交流,有去国外交流学习的机会!

本次培训为高端生物信息系列培训,内容是关于基因组学及NGS数据分析的综合性培训!
包括基因组、转录组、表观基因组和癌症基因组里面常见和最新的分析方法!
培训专家来自中国科学院院士,哈佛大学医学院、美国Broad研究院的华裔和外籍专家,国内著名高校教授!
这些专家所在研究组在国际上率先开发出了Haploview,PLINK, GATK等目前遗传学分析、全基因组关联、二代测序等常用软件。

且大多在Nature、Science等顶级期刊发表过研究论文!
全程中英文讲解,理论讲授和上机操作搭配进行!
这是一次与国际最顶尖专家零距离交流与学习的难得机会!

联合主办单位: 北京市科学技术研究院,北京市计算中心 、北京新抗元生物技术有限公司  
协办    单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心

培训时间:2018/10/29-2018/11/2
授课老师介绍

授课老师

授课老师单位

院士待定

 

许益祥

美国哈佛医学院,哈佛公共卫生学院

黄海亮

美国哈佛医学院,麻省总医院

Lori Chibnik

美国哈佛医学院,美国哈佛公共卫生学院

李婉萍

短序列比对软件MOSAIK的发明人

徐书华

中国科学院

杨怀一

中央研究院

Chia-Yen Chen

Harvard School of Public Health

Anne Feng

 

周一鸣

北京新抗元生物技术有限公司

培训会日程计划表

Date

Time

Instructor

Topic

2018/10/29(Day1)

8:30-9:00

 

Registration

9:00-9:30

Yubao Chen
YiMing Zhou
Hailiang Huang

Opening remarks and introduction to the workshop

9:30-10:30

院士报告

待定

10:50-12:00

Hailiang Huang

Genetics of human complex disorders

1:00-2:30

Hailiang Huang

Genetic association studies (quality control, common variant association

studies, meta-analysis)

2:50-5:00

Anne Feng

Hand-on: genetic association studies

 

 

 

 

2018/10/30(Day2)

9:00-10:30

Chia-Yen Chen

Common variant heritability and genetic correlation

11:00-12:30

Chia-Yen Chen

Conducting studies using public resources and biobanks

1:30-3:00

Wan-Ping Lee

Introduction to NGS technology and platforms

3:30-5:00

Wan-Ping Lee

NGS clinical practice

 

 

 

 

2018/10/31(Day3)

9:00-10:30

Wan-Ping Lee

Variant annotation

11:00-12:30

Shuhua Xu

Primer on population genetics

1:30-3:00

Shuhua Xu

Phylogenetic tree and population structure analysis

3:30-5:00

Lori Chibnik

Introduction to Alzheimer’s disease

 

 

 

 

2018/11/1(Day4)

9:00-10:30

Hwai-I Yang

Liver biomarker studies

11:00-12:30

Anne Feng

Exome-sequencing analysis in scale

1:30-3:00

Lori Chibnik

Study design, multiple resting, power and sample size estimate

3:30 – 5:00

All Instructor

Panel discussion

 

 

 

 

2018/11/2(Day5)

9:00-10:50

Yiming Zhou

Cancer genome analysis for precision medicine

11:00-12:30

Yi-Hsiang Hsu

Database, Biobanks and Online Resources:
TopMed, TCGA, GTEX, UKBIOBANK, etc….                

1:30-3:00

Yi-Hsiang Hsu

Functional Genomics: Functional annotation, Functional SNP and

Targeted Gene Prediction, Chromatin accessibility, TF binding footprint,

ATAC-seq

3:30-5:00

Yi-Hsiang Hsu

Cancer Genomics: Somatic Mutation and Neoantigen

 

 

 

 备注:实际授课内容可能会根据报名表调研情况进行微调。
报名费用:


报名种类

优惠对象

注册费

A

在校的学生(需学生证)

6500元

B

老师(工作人员)、企业工作人员

8500元

注册费含听课费、资料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机操作

报名优惠政策:
1、2018年9月20日前(含2月28日)报名缴费优惠500元。
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,每人可享受85折。
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
付费方式:
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账     号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名”)
请联系
员老师   010-59341773,18701529461(微信同号), 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

培训地点乘车路线:公交:公交站点 —— “丰贤中路站”下车到达园区“北京科学技术研究院现代制造技术产业园(简称‘北科产业’),工作日门口一般会停放好几辆大巴(园区班车)。
公交路线:365 路、570 路到 丰贤中路站,438 路到 丰贤路口南站(下车后需沿丰贤中路步行 700 米)
地铁: 建议大家乘坐地铁,从4号线西苑站换乘16号线到永丰站下车,B口出,沿永盛北路直行,拐至丰贤中路上,步行约12 min。

 

 

 

 

 

 

附录一:报名回执单


单位名称

 

通讯地址

 

姓名

性别

民族

职务/职称

研究方向

实验室/科室

手机

邮箱

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

注:

3人以上团体报名每人可减少300元;4+1团报,可免费赠送一个名额。

信息渠道

□中心主页     □邮件宣传     □QQ     □微信     □朋友推荐      □生物论坛  其他        

报名种类

A(在校学生)      B(老师、企业工作人员)

课程了解情况

☆☆☆☆☆

是否有所列背景/经验

A.大数据分析       B. R语言          C. Unix/Linux操作系统

感兴趣内容

A. 基因芯片技术及其数据分析 B. 测序技术及其数据分析 C. 常见病的遗传学分析 D. 生物标记物的研究 E. 群体遗传学 F. 甲基化、调控和功能基因组学分析 G. 肿瘤和体细胞遗传学分析 H.(自行填写)

期待通过培训收获

A. 了解领域的前沿进展 B. 了解领域的基础知识 C. 获得实际分析数据的能力 D.  (自行填写)

是否需发票
(是□;否□)   

发票
抬头

名        称:
纳税人识别号:

发票性质:
□ 增值税普通发票
□ 增值税专用发票

发票内容:
□ 培训费
□ 会议费
□ 会议注册费

备  注:

增值税专用发票,请提供一版纳税人证明材料

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

附录二:主要授课老师介绍
1)杨怀一
Macintosh HD:Users:henry:Dropbox:My:CV:My photo1.jpg杨怀一教授,2006 年于台湾大学公共卫生学院流行病学研究所取得博士学位。2006 - 2011 年在中央研究院基因组研究中心进行博士后研究。2011-2013 年为中国医药大学临床医学研究所副教授和中国医药大学附设医院分子与基因体流行病学研究中心副研究员。2013 年至今为中央研究院基因体研究中心副研究员,并为国立阳明大学临床医学研究所副教 授。
杨怀一教授的研究方向有: (1) 使用纵向随访研究描述慢性乙型和丙型自然病史中里程碑转变和疾病进展的发生率和决定因素。(2) 开发和验证风险预测工具,其中纳入了多个非侵入性临床参数,用于预测慢性乙型和丙型肝炎的标志物转换和相关末期肝疾。(3) 使用高通量分子和基因组技术,包括全基因组关联研究,下一代测序,多重蛋白质测定和聚糖阵列,研究病毒和宿主免疫因素对病毒性肝炎的重要作用。(4) 探索有用的基因组,蛋白质组和糖基预诊断生物学特 征,用于预测主要癌症,以开发癌症早期诊断和癌症预防性疫苗的新策略。

 

 2)徐书华
../../../个人资料/2017-11_华表/徐书华.jpg徐书华, 中国科学院特聘研究员,中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究组长、博士生导师,兼任上海科技大学特聘教授;2012年起担任德国马普学会与中科院共同支持的马普青年科学家小组组长。2013年入选国家“万人计划”第一批“青年拔尖人才”;2015年获国家杰出青年基金;2016年入选上海市优秀学术带头人;兼任上海市遗传学会常务理事、上海市人类学会理事、中国遗传学会青年委员会委员、Molecular Genetics and Genomics(德国)编委、Human Genomics(英国)编委、Hereditas(英国)编委、Genes and Genetic Systems(日本)编委、Scientific Reports(英国)编委、BMC Genetics (英国)编委(Section Editor)。长期致力于群体基因组学研究,专注于人类遗传和微观进化问题;发展和运用群体基因组学方法和计算生物学手段在人群的遗传结构、环境适应和微观进化机制研究方面取得了系统性的成果。目前担任国家自然基金委重大研究计划集成项目和重点项目负责人、中科院先导专项(B类)项目负责人。在Science,PNAS,AJHG等发表SCI论文80多篇;曾获全国百篇优秀博士论文、中科院青年科学家奖、上海市青年科技启明星(A类)、教育部自然科学一等奖、国家自然科学二等奖等。

 

  3Yi-Hsiang Hsu许益祥

 

5.jpg许益祥教授,毕业哈佛医学院基因医学组,现任哈佛医学院贝斯以色列女执事医疗中心衰老疾病中心主任,同时担任麻省理工-哈佛大学Broad研究所和哈佛医学院定量基因组学助理教授,哈佛公共卫生学院分子和综合生理科学副教授。
许益祥教授为统计遗传学家/计算生物学家,研究方向有:(1)衰老相关常见疾病的遗传贡献(如骨质疏松症,sarcopenic肥胖、代谢综合征、2型糖尿病和高血压),基于群体的NGS,如全基因组测序,外显子组测序和全基因组关联方法,用于识别与复杂特征相关的常见和罕见变异。(2)使用由ENCODE和美国NIH路线表观基因组学项目产生的组织和细胞特异性基因调控状态来预测GWAS位点的非编码致病变体和靶基因; (3)多表型关联分析的统计方法开发; (4)使用系统遗传学和生物功能方法整合组学数据(基因组学,转录组学,表观基因组学,蛋白质组学和代谢组学) 和(5)使用代谢组学鉴定骨质疏松的生物标志物。

4Hailiang Huang黄海亮

 

6.jpg2012年毕业于约翰霍普金斯大学医学院生物医学工程系,师从Joel Bader博士,主要研究方向是计算生物学,系统生物学以及人类遗传学。毕业后,黄博士加入麻省总医院Mark Daly博士的研究团队,从事人类基因组学研究。黄博士通过测序和分型分析人类基因组,结合生物网络和系统生物学的手段,找出和疾病相关的遗传信息,并研究疾病发生的机理。黄博士的研究成果发表在Nature, Cell, Genome Research, PLoS Genetics等多家期刊,并拥有美国专利一项。其中关于全基因组关联研究方法的文章(GWiS)被广泛用于寻找与心血管疾病、精神分裂症、自闭症、老年痴呆等遗传疾病有关的基因。

5WenPing Lee李婉萍

 

7.jpg国立台湾大学电子工程博士学位,获得学校杰出研究奖,曾在波士顿学院任高级研究员和博士后,并在卡内基梅隆大学做访问学者,目前就职于Jackson Lab for Genomic Medicine 。李婉萍博士也是千人基因组项目中的一员,拥有生物信息学,电气工程,计算机科学和商业的多学科背景,并开发了若干生物信息学工具,比如短序列比对软件MOSAIK,突变预测软件TANGRAM,以及SIMD Smith-Waterman算法实现。李婉萍目前的研究工作是开发基于图表的参考基因组,以用于代表大量的完整基因组。

6Lori Chibnik

 

8.jpg生物统计学家,在哈佛大学陈曾熙公共卫生学院和哈佛大学医学院任助理教授。Chibnik博士在国际卫生领域获得公共卫生硕士学位,并在波士顿大学研究疾病风险预测模型方法,获得生物统计学博士学位。Chibnik博士在其职业生涯中,已经开发并评估了多个疾病的预测模型,如HIV,产前筛查和自身免疫性疾病的预测模型,并将其应用于各种疾病。
Chibnik博士目前的研究兴趣是阿尔茨海默病和老年痴呆的遗传学和基因组学,侧重于纵向队列。除研究工作外,Chibnik博士设计的培训班和创新的教学技巧也在国际上具有知名度,已经为不同的国家和机构开发了多个生物统计学课程,其最近一个培训班系列是为非洲地区科学家的而开发的。目前,Chibnik博士在哈佛大学陈曾熙公共卫生学院和Stanley Center for Psychiatric Research at Broad Institute 主持全球神经精神疾病遗传学培训计划。

7Chia-Yen Chen

 

Postdoctoral Research Fellow of Smoller lab, Psychiatric and Neurodevelopmental Genetics Unit,
Neale lab, Analytic and Translational Genetics Unit, Massachusetts General Hospital and Stanley Center for Psychiatric Research, Broad Institute of MIT and Harvard from 11/2013.
The Supervisors were Jordan W. Smoller and Benjamin M. Neale. Recent research focuses on novel statistical genetics methods for Mendelian randomization,Using electronic health records and biobanks for psychiatric research, Genome-wide association studies of Posttraumatic Stress Disorder (PTSD) and stress-related disorders , Understanding genetic architecture of complex traits and shared genetic components across traits , Genome-wide studies for psychiatric disorders in Asian Population.

8)周一鸣
周一鸣.jpg周一鸣,2005年博士毕业于清华大学生物系,2018年至今任北京新抗元生物技术有限公司CEO。 2014年至2017年任博奥生物集团有限公司首席信息官,兼转化生物信息研究院院长。之前长期在美国纽约大学医学院,阿肯色医科大学,哈佛大学医学院从事生物医学大数据和基因组学的研究,涉及基因调控网络、多发性骨髓癌的基因组分析、中风相关的心脑血管组学、糖尿病人胰岛素抗性原理和生殖健康组学等多个方向。已发表SCI论文 40 篇,被他人SCI引用 > 1000 次。多篇文章文章发表在Nature,Blood,PNAS,Nature Cell Biology,Nature Biotechnolgy等国际一流杂志。其中作为数据分析专家,参与美国药监局领导的 MAQC 项目 II 和 III 期。文章发表在 2010年 和2014年的 Nature Biotechnology。基于以上成果,受邀参与编译中英文学术著作 2 部。获得授权专利 5 项。其中美国专利 3 项,世界专利 2 项。作为主要生物信息学家,参与了申请 2 项美国国立卫生研究院资助项目,以及多项其它研究项目。作为首席科学家,主持完成国家高技术研究发展计划( 863 计划)课题“基于区域医疗与健康大数据处理分析与应用研究”(课题编号:2015AA020110)。该课题是国家级第一批生物医学大数据方向的重点资助课题。

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