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2017年10月30-11月1日生物信息数据处理与perl语言编程应用专题培训班
2017.10.23-10.25 生物信息学数据分析在生命科学中的应用拓展培训班
2017年10月16-18日实用生物信息绘图研习班
2017.9.23-9.25 中国生物工程学会第十一届学术年会暨2017年全国生物技术大会
2017年10月23-24日组学技术在生命科学中的应用专题培训
2017年10月25-27日基因组关联分析技术应用培训班
2017年10月18-20微生物组学分析研讨班
2017年10月12-15日基于NGS的肿瘤精准医学研究基础培训班
2017年9月26-29日生物信息学软件与工具使用培训班
2017年9月19-21日基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班
2017年9月7-9日生物信息学与精准医学培训班
2017年9月4-6日重测序分析与转录组分析在动植物研究中的应用专题班
2017年9月1-3日分子模拟与蛋白互作研习班
2017.8.21-25 实用生物信息学研讨班
2017年8月2-4转录组专题研讨班
2017.8.5-6宏基因分析专题研讨班
2017年8月7-11日实用生物信息学研讨班
2017年8月12-14日生物信息技术应用讲习班
2017年8月15-18日数据分析与R语言制图专题研讨班
2017年8月21-25日基于多组学的慢性疾病研究研讨班

基因组关联分析技术应用培训班

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 
     中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 
     北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 
     中国生物工程杂志 
     北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

    北京微生太科技有限公司 
举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间2017年10月25-27日  上午9:30-12:00,下午13:30-17:30

日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

1、 基因组学与生物信息学概述;

2、 基于群体遗传的数据获取;

3、 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;

4、 常用GWAS数据库介绍;

Plink软件基础应用

5、 Plink软件应用;

6、 Plink文件格式生成与解析;

7、 等位基因频率计算;

8、 -温平衡计算;

9、 目标区域数据提取;

10、 基因组关联分析流程;

11、     关联分析结果分析与p校正;

第二天

基因型填充Imputation

12、 基因型填充Imputation的原理及应用;

13、 Beagle软件介绍与应用;

14、 基因组填充的方法与分析流程;

15、 1000G数据应用

Plink软件进阶应用

16、 基于家系的关联分析;

17、 曼哈顿图的绘制与结果展示;

18、 SNP位点的condition分析;

19、     Meta gwas数据分析;

第三天

Haploview软件

20、 Haploview软件应用;

21、 Haplotype单倍型分析;

22、 LD连锁不平衡指数计算;

23、 SNP marker之间的r2D值等计算;

Tassel软件

24、 Tassel软件应用;

25、 Tassel基于命令行的批量数据分析;

26、 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;

  (课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练,重实践,力求实效
小班授课,个别辅导
【报名费用】注册费:3800元/人(含听课费、资料费(材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。)、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。  

【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款 
    单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  
    开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、9.20日前报名并缴费,可享受减免300元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【联系咨询】QQ:2814500767
 徐老师   010-59341771,邮箱:yurt@bcc.ac.cn
 

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