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2017年12.1-3 实用生物信息绘图研习班
2017.12.26-28 基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班
2017.12.21-24 基于NGS的肿瘤精准医学研究基础培训班
2017.12.19-22 实用微生物组学信息分析精品班
2017.12.14-17 生物信息学Python语言培训
2017.12.12-15 生物信息学软件与工具使用培训班
2017.12.7-9 生物信息学与精准医学培训班
2017.12.4-6 重测序分析与转录组分析在动植物研究中的应用专题班
2017.12.1-3 分子模拟与蛋白互作研习班
培训班—报名回执表 下载
2017.11.27-30 实用微生物组学信息分析精品班
2017.11.20-24 基于多组学的慢性疾病研究研讨班
2017.11.17-19 表观遗传学数据分析研习班
2017.11.14-17 数据分析与R语言制图专题研讨班
2017.11.11-13 生物信息学技术应用讲习班
2017.11.6-10 “实用生物信息学”研讨班通知
2017.11.4-5 宏基因组分析专题研讨班
2017.11.1-3 转录组学专题研讨班
2017.10.20-10.22第三代测序技术及信息分析研讨班
2017年10月30-11月1日生物信息数据处理与perl语言编程应用专题培训班

转录组学专题研讨班通知


近年来,随着高通量测序技术的迅猛发展,转录组研究从以前的微阵列技术,SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控,癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定,遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,北京市计算中心生物计算事业部举办“转录组学”培训研习班。

主办单位: 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

北京微生太科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路73号楼
培训时间 2017年8.2-4日(报名中)
本次课程时间:   上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00

日期

授课题目

授课内容

第一天

转录组学前沿概述

  1. 转录组技术发展前沿动态
  2. 转录组应用案例及应用热点

转录组学实验和分析基础

  1. 转录组学研究的实验技术
  2. 转录组技术流程及技术细节(重点讲解)
  3. 常用的转录组测序建库技术

转录组学中lncRNA的研究

  1. lncRNA目前的定义、应用和发展
  2. lncRNA的生物学过程(重点讲解)
  3. lncRNA的测序(重点讲解)
  4. lncRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)

第二天

Linux基础操作

  1. Linux基础操作

De novo转录组数据分析上机实践

  1. 原始测序数据的检测和预处理(重点讲解)
  2. 使用Trinity拼接转录组数据(重点讲解)
  3. 原始数据与拼接转录本的比对(重点讲解)
  4. 表达量统计和差异表达分析(重点讲解)
  5. 使用blast对转录本进行功能注释(重点讲解)
  6. 寻找转录本的ORF,翻译蛋白质序列

Reference based转录组数据分析上机实践(一)

  1. 转录组数据准备和软件介绍
  2. 使用Tophat进行转录组数据的比对(重点讲解)
  3. 用IGV查看比对结果
  4. 使用cufflinks进行表达量估计和分析(重点讲解)
  5. 使用samtools检测转录组数据中的突变(重点讲解)
  6. 利用DAVID数据库进行差异表达基因的功能分析(重点讲解)

第三天

Reference based转录组数据分析上机实践(二)

  1. 利用tophat和cufflinks组合,预测转录本
  2. 使用CNCI预测新的lncRNA转录本(重点讲解)
  3. 使用LncTar软件预测lncRNA调控的靶基因(重点讲解)

microRNA测序与数据分析(包含上机实践)

  1. microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义
  2. microRNA的生物学过程(重点讲解)
  3. microRNA的测序(重点讲解)
  4. microRNA测序数据分析软件(重点讲解)
  5. microRNA测序数据预处理(重点讲解)
  6. microRNA的预测(重点讲解)
  7. microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)

课程答疑

学员可以准备自己的数据,带着问题来实践课程所学内容,直接应用与科研当中。

(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
报名费用  注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。
报名优惠政策
1、7.15日前报名缴费的学员每人可优惠300元,
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、 同时报2个以上培训班的可额外优惠200元               
5、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)
请联系 QQ号:2814500767
于老师   010-59341771,15600660904,邮箱:yurt@bcc.ac.cn

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